jmol是维分一款分子查校验软件 ，可以扶植你在软件上查校验分子模型以及查校验原子模型 ，显示提供多个数据显示，工具 官内置脚本编辑器
，维分可以对显示的显示内容编辑，可以对查校验分子模型的工具 官脚本编辑 ，拥穿着查校验氢、维分碳、显示氨、工具 官氧
 、维分磷、显示硫 、工具 官氨基酸、维分核酸
、显示杂原子等内容 ，工具 官你可以在显示菜单界面选择需要查校验的内容，也可以对原子的显示方式定义，在原子显示界面可以选择15%范德华
、20%范德华
、25%范德华、100%范德华 ，拥穿着的功能很多，需要的挚友可以下载体验 ！

软件功能

　　- 新的MUTATE命令可以轻快修改蛋白质残留，这与设置选择dragMinimize一起可以轻快调整突变组

　　- 生物分子注释，包括DSSR ，RNA3D，EBI序列域和PDB验证数据

　　- 用于筹备数组 ，数据表，平面和多面体的附加数学函数

　　- 简化的JmolSQL，用于筹备注释和其他基于数组的数据

　　- 新的DRAW和CGO选项，包括简易的PostScript图形阅读

　　- 在弹出窗口或网页上的位置内显示图像的新功能

　　- 融入NBO（仍处于开发阶段）

　　- 几个重要的新负载选项 ，包括容量填充

　　==（而不是单元格填充）的晶体数据
，晶格缩放 ，

　　- 与多面体有关的重大改进，包括扩展

　　立体化学SMILES和SMARTS到原子环境，多面体匹配和polyhedra（）函数。

　　- 为调制结构CIF文件加载增补勒让德多项式

　　- 归并到AFLOW计算固态物理项目中、

软件特色

　　1
、jmol是提供化学结构查校验功能 ，可以扶植你查校验分子的结构

　　2、可以通过3D的方式查校验分子结构

　　3、软件基于Java开发，具有化学品，晶体 ，材料和生物分子的特征

　　4、新功能
：“...” 。split（“ t”，true）//将字符串拆分为数组数组

　　5、新功能：“....”
 。split（“” ，true）//将字符串CSV拆分为数组数组

　　6 、AFLOW二元合金文件阅读器可以过滤“list = xx”以裸露值列表

　　7 、拥穿着动画显示，一次、循环、中断动画
、回到第一帧 、转到上一帧

　　8 、在显示界面可以设置标签、矢量 、缩放、透视深度、坐标轴
、边界框 
、氢原
、向量
、测量调整大小

使用计划

　　1 、下载以后点击“jmol.bat”打开 ，这里提供很多会谈明文件，用户可以查校验相关的描述

　　2 、jmol.bat的打开界面就是这样的 ，等待数据加载落成

　　3 、查校验的界面如下图，可以在这里建立新的查校验内容

　　4 、打开功能 ，可以将你需要查校验的内容打开

　　5、得到PDB功能，输入四字母的PDB模型D或“=”和一个三位数配合基ID

　　6、得到MOL功能
，输入一个化合物的名字或ID(SMILES,inchi,CAS） ，前言带“：”从PubChem导入，不然Jmol将会用NCI/NIH分解器

　　7、提示Jmol控制台，可以在这里显示脚本内容
，显示编辑器内容

　　8 、编辑器的界面在这里显示 ，可以打开新的脚本

　　9、显示设置功能，可以显示氢原子，可以显示量度 ，透视深度、坐标轴、边框

　　10 、 RasMolChime兼容的坐标轴方向旋转 、文件预览(需重启jmol)，清除历史(需要重启Jmol)

　　11 、原子设置界面，可以显示默认原子尺寸、范德化华半径百分比)

　　12 、化学键功能，可以计算化学键，拥穿着自动化模式以及不计算化学键

　　13 、提示默认键半键的设置界面，键的容许误差:两个键的半径+这个值

　　14 、选取功能 ，拥穿着氢、碳 、氨、氧、磷、硫、氨基酸、核酸、杂原子  、水

使用会谈明

　　JmolApplet0.jar，JmolApplet0（fewSuffixes）.jar ==== applet ，即仅在嵌入网页时运行的程序版本
。

　　applet根据其功能分为几个部分，因此如果页面不需要组件，则不会从服务器下载该组件。

　　即使您的页面没有使用某些文件提供的功能，仍然建议您将所有JmolApplet0 * .jar文件放在您的服务器上，因为弹出菜单和Jmol控制台都允许用户访问Jmol的部分内容可能没有思索过
。

　　如果您使用Jmol.js（这是推荐的计划），这个拆分版本将默认使用。为此，使用最简易的jmolInitialize（）形式，只是指示包含jar文件集的目录或文件夹：jmolInitialize（“directory-containing-jar-files”）

　　例如，

　　jmolInitialize（ “”）

　　（如果jar文件与网页位于同一文件夹中）jmolInitialize（“../ jmol”）

　　（如果jar文件位于并行文件夹中 ，名为jmol）

　　4.1.2 ==== JmolAppletSigned0.jar，JmolAppletSigned0（fewSuffixes）.jar ====

　　applet的等效版本，但这是一个“签名”applet（Java安全语言中的术语）。这意味着它必须由网页访问者授权才能运行，但是它对文件访问的安全性限制较少 。例如，它可以访问用户硬盘任何部分或任何其他Web服务器上的文件。

　　通常，用户会收到一条消息，询问他们是否要收受“证书”，或者他们是否“信任”小程序（“请参阅下面的注释”） 。 JmolAppletSigned.jar应该思索到这一点。除了读取文件之外，Jmol目前还没有使用签名小程序的其他功能
，例如访问系统剪贴板或编写文件 。仅在您知道自己在做什么并思索了安全尴尬时才使用。

　　要在Jmol.js中使用它，请使用以下格式 ：jmolInitialize（“directory-containing-jar-files” 
，true）

　　或jmolInitialize（“directory-containing-jar-files” ，“JmolAppletSigned0.jar”）